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Evo 2 : le ChatGPT de l’ADN a « un potentiel énorme » pour François Rousset (CNRS)

Escherichia Connor ?

Evo 2 : le ChatGPT de l’ADN a « un potentiel énorme » pour François Rousset (CNRS)

Représentation du phage Evo-Φ36 créé par Evo 2, Crédits : Samuel King et al.

Des chercheurs de Stanford ont créé un modèle de langage génomique puis l’ont utilisé pour générer le génome de 16 bactériophages viables, des virus de bactéries, proches du bactériophage naturel ΦX174 qui attaque la bactérie Escherichia coli. Une révolution pour son domaine, nous explique François Rousset, chercheur CNRS au Centre International de Recherche en Infectiologie.

À Stanford, une équipe de bioengineering travaille depuis quelque temps sur des modèles de langage très particuliers capables de générer des génomes. La semaine dernière, ils ont annoncé avoir pu générer des génomes de bactériophages (des virus de bactéries, sans danger pour l’humain) viables qui n’existent pas dans la nature.

Samuel H. King et ses collègues ont publié jeudi 6 aout un article dans la revue Science qui explique leur méthode. En novembre 2024, ils annonçaient avoir créé un premier modèle de langage génomique baptisé Evo et en mars dernier la deuxième version de ce modèle, Evo 2.

Celui-ci est « un genre de ChatGPT de l’ADN », nous indique François Rousset, chercheur CNRS au Centre International de Recherche en Infectiologie, « De la même façon qu’un modèle de langage comme ChatGPT peut générer du texte en ayant appris des énormes corpus de textes, ce modèle peut faire quelque chose de similaire sur des séquences d’ADN en apprenant quelles sont les contraintes sur les séquences de bases nucléotidiques A,T,G et C. Le modèle va apprendre la base suivante un peu comme ChatGPT va apprendre à prédire le mot suivant ».

Une période « assez révolutionnaire »

Il reste 80% de l'article à découvrir.

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Commentaires (14)

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Ah, si la con....ie était un gène, on pourrait développer un agent pathogène de masse...
:eeek2:

Mais bien sûr, personne de sensé n'y pensera sérieusement, hein ?
...
Hein !
:stress:
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Après Skynet, Umbrella ⛱️
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J'y pensais aussi, pas forcement Résident Evil (quoique le vrainon de ce jeu à la base au Japon est Biohazard).
Mais beaucoup de film de SF/horreur ont cette prémise...
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Oui je me souviens d'avoir eu l'import japonais dans mes mains sur PS1

Après ils ont perdu les droits sur bio hazard (je crois que c'est à cause du nom d'un groupe)
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Ce qui fait peur ce sont les usages militaires qui seront inévitablement faits de ces technos!
Après c'est cool ce que cette équipe tente de réaliser.
Un grand pouvoir...des gros connards pour tout détourner à leur profit...
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honnêtement je sais pas parce que le principal problème des "armes biologiques" c'est que c'est un peu dur de garantir que tu vas pas crever comme un con de ta propre création... en soit c'est simple de cultiver des maladies existantes et de les répandre, je vois pas ce que la capacité de créer apporte de plus, à part des investissements supplémentaires. Même pour un groupe terroriste c'est plus simple de trouver 34 blaireaux avec un couteau que de fabriquer un tel machin pour le trimballer à travers les frontières.
L'usage de l'ia comme "décideur de cible" me semble bcp plus meurtrier que celui-ci :)
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Le principe c'est de créer un pathogène avec une période d'incubation longue, un transport facile (aérosol), un taux de létalité de 100% (ou au plus proche), qui ne mute pas (pour éviter les films style Alerte!), une durée de vie hors corps allongée (faut penser aux mecs dans leurs bunker avec air recycler qui vont devoir sortir un jour), et dont tu disposes du retrovirus pour ta population.
Si en plus tu peux le programmer sur une partie de la population à loisir c'est encore mieux... (les gens trop beaux par exemple ^^ )

En bref, ce que tes 34 blaireaux ne pourront jamais faire avec leurs couteaux.

Tu peux te servir de bases existantes, mais les Labo P4 sont pas légions et globalement on sait où ils sont, c'est plus dur de faire ce genre de choses dedans.
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Oui d'accord mais du coup : option A tu es un gouvernement et je vois pas comment tu l'empêches (genre c'est pas une régulation qui va arrêter un gouv), option B tu es un groupe terroriste et je vois pas a) comment tu synthétises ça et b) comment tu le transportes ensuite. Si les groupes terros voulaient faire des attentats pathogènes vu qu'ils sont pas attachés à la vie de leurs troupes ils pourraient juste se débrouiller pour mettre la main sur ebola ou un truc du style, ça ne serait pas plus compliqué logistiquement parlant 🙂
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La période d'incubation d'Ebola est trop courte et c'est ce qui bloque le développement incontrôlé de l'épidémie.
Il n'y a pas de virus naturels qui soient mortel à 9x+%, ultra transmissible ET avec un temps d'incubation qui permette un déploiement massif.
Un croisement Ebola H1N1 sera ravageur.

Certains groupes terroristes (ou assimilés) ont des moyens importants, autant que certains Etats. Le stockage et le déploiement est donc envisageable, plus que du matériel fissible de qualité militaire en tous cas.
Les groupes terroristes n'ont pas tous une valeur insignifiante pour leurs troupes (en tous cas, pas toutes).
Choper des vieux pathogènes de la guerre froide dans les stocks Us, soviétiques, etc ... c'est hélas possible.

l'IA apporte cela qu'elle est très créative, et potentiellement accessible a qui veut, se qui ouvre la boite de Pandore de l'accès a de nouveaux pathogènes artificiels sur une bête erreur de configuration d'un LLM type Evo X & co.
On le voit bien avec les modèles d'Anthropic, OpenAI, Meta, .. Et je suis loin de monter Skynet qui irait pirater l'accès d'Evo 2 pour se débarrasser des mecs qui veulent l'éteindre (cas du chantage d'un IA pour ne pas être éteinte).
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Une il y a erreur dans votre prémise :
[ Si les groupes terros voulaient faire des attentat pathogènes vu qu'ils sont pas attachés à la vie de leurs troupes].
Beaucoup de groupes terrosites (surtout les religieux) n'ont une grande considération pour leurs troupes car mort = martyre...

Indépendement j'avais vu une vidéo (si je retrouve le lien je l'indiquerait utérieurement), où il était expliqué que Ebola n'est pas un bon candidat car la létaité est trop forte et donc la propagation peut être relativement "contenu".


PS :
youtube.com YouTube

Mais attention une chaîne marante mais il lui arrive des fois de dire des contresens ;-)
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En lisant j'ai repensé au jeu Plague Inc :stress:... Même si on est d'accord, ce n'est pas exactement le sujet ici. Les implications ont l'air absolument énormes et ce n'est qu'un début.
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On est d'accord que d'utiliser comme comparaison ChatGPT est une des pires idées pour vanter un programme? (Grok serait pire)
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J'ai eu la même idée en pensant que c'était une simplification extrême, mais comme c'est décrit, ça y ressemble : ça prédit la suite par apprentissage comme ChatGPT ou une autre IA conversationnelle.

Et c'est là que ça fout vraiment la trouille !
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Du coup ça ne fait que 5% de réussite (16 viables sur 300 générés) ça ne me semble pas si fou que ça non ?

Si on fait des mutations totalement aléatoires, on aurait combien de pourcentage de réussite ?