Patrick Hetzel est un soutien régulier de l'homéopathie et des médecines alternatives, a remis en cause la politique vaccinale, et s'est opposé à l’article 4 de la loi contre les dérives sectaires, visant les personnes qui provoquent « l’abandon ou l’abstention de soins ». Il a partagé en 2020 l'infox selon laquelle des euthanasies de personnes malades du Covid-19 seraient pratiquées illégalement dans des hôpitaux français par utilisation du Rivotril (clonazépam).

Il vote contre le droit à la procréation médicalement assistée (PMA) aux couples de femmes et aux femmes seules, ainsi que contre la constitutionnalisation de l’IVG.