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L’application Folding@home permet de prioriser les projets liés à Covid-19

L’application Folding@home permet de prioriser les projets liés à Covid-19

Le 20 avril 2020 à 09h38

Les responsables affirment que c’était une demande des utilisateurs, et l’option a été ajoutée aussi rapidement que possible.

Même si ce n’était pas la priorité, quelques bugs sont corrigés au passage, mais uniquement ceux n'entraînant pas de retard pour la mise en service de la nouvelle fonction. 

L’équipe en profite pour annoncer qu’une nouvelle application est en cours de développement. Elle « améliorera les performances de Folding@home et facilitera l’implication de la communauté dans son développement ». Plus de détails seront donnés prochainement.

À l’heure actuelle, la puissance totale de calcul disponible est de 2,5 ExaFlops. Pour rappel, si l’aventure vous tente, vous pouvez rejoindre la mini-team NXi en utilisant un pseudo du type « [Inpact]_Username ».

Le 20 avril 2020 à 09h38

Commentaires (44)

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Ça fait des jours et des jours que j’essaie de revenir et j’ai aucun projet

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Pareil.



Est-ce que c’est parce qu’il y a assez de participants que pour que la queue des projets soient constamment vide ? Auquel cas, c’est plutôt une bonne nouvelle :)

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Sur mon PC ça tourne sans problème, la dernière fois que j’ai regardé c’était pour une sorte d’assemblage de protéines du coronavirus.



Il faut savoir que la puissance de calcul a explosé, leurs serveurs ont apparemment un peu de mal à suivre <img data-src=" />

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Trop de risque de se faire espionner sur son PC en faisant tourner du code par cette application. Je tiens à ma vie privée.

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?



peux tu fournir plus d’infos, je ne suis pas sur de comprendre

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En suivant vos liens, je viens de voir qu’on pouvait le lancer dans une sandbox via un script (à voir pour ceux qui comprennent et nous donner confirmation du contenu ;) )

github.com GitHub

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Perso ça tourne bien sur le cpu. Oracle microsoft amazon et autres ont fourni des serveurs pour attribuer les projets (voir la video de linus tech tip) et il y a des projets d’universités partenaires donc plus de boulot.

Sur le gpu j’ai rien mais j’ai réussi à le faire tourner que depuis hier soir…

Ceux qui n’ont rien tentez un redémarrage ? J’ai vu sur un forum que ça a fonctionné pour certains

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Il faut télécharger la dernière version pour avoir le choix COVID-19.

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Ce genre de projets a une réelle utilité ? Ca calcule quoi au final ? Ca aide à trouver un vaccin ? <img data-src=" />

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fred42 a écrit :



Trop de risque de se faire espionner sur son PC en faisant tourner du code par cette application. Je tiens à ma vie privée.





Encapsule le dans une sandbox sous 10 Pro, ou dans une VM (dans ce cas, on ne profite plus du GPU, qui explose littéralement le CPU)


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Commence on tue la tache actuelle pour passer à COVID ?



Finish ne suffit pas.

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Je n’ai pas Windows mais une sandbox dont on ne s’échappe pas, ça n’existe pas encore. Quant à une VM, elle ne protégera pas des failles des processeurs ou des VM elles-mêmes.



Faire tourner de telles applis, c’est vraiment prendre un risque important pour sa vie privée.

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Ça a autant d’utilité que les projets du même type qui recherch(ai)ent les extra-terrestres (SETI@home par exemple).



Et c’est mauvais pour l’environnement, tous ces PC qui restent sous tension H24.

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fred42 a écrit :

Je n’ai pas Windows mais une sandbox dont on ne s’échappe pas, ça n’existe pas encore. Quant à une VM, elle ne protégera pas des failles des processeurs ou des VM elles-mêmes.



Faire tourner de telles applis, c’est vraiment prendre un risque important pour sa vie privée.



Pour tout ce qui est faille, Java t’en fait prendre tout autant,

sandbox ou VM. C’est pareil pour presque tous les logiciels du coup, ou moindre script que tu lances sur ton linux sans avoir bien analysé toutes les lignes, car lui aussi n’échappe pas aux failles CPU, et linux n’est pas non plus exempt de failles et d’attaques.

&nbsp;

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Pour ceux qui n’ont pas de WU, il faut faire un Pause/Fold de temps en temps quand ça fait un moment que rien ne travaille.



Ca tourne pas mal sinon en ce moment chez moi; du quasi non stop sur CPU, et 5 ou 6 WU/jour pour le GPU.

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Chercher les ET a pour toi autant d’interêt que chercher un traitement au Covid????

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Ils ont peut-être les connaissances pour nous trouver un remède ! <img data-src=" />

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Jarodd a écrit :



Ce genre de projets a une réelle utilité ? Ca calcule quoi au final ? Ca aide à trouver un vaccin ? <img data-src=" />






 "Folding@home, parfois désigné par l'abréviation FAH, est un projet de recherche médicale dont le but est de simuler le repliement des protéines dans diverses configurations de température et de pression afin de mieux comprendre ce processus, et d'en tirer des connaissances utiles qui pourraient, entre autres, permettre de développer de nouveaux médicaments, notamment contre la maladie d'Alzheimer, la drépanocytose et certains types de cancers. C'est un projet de calcul distribué qui fonctionne avec la puissance de calcul non utilisée des ordinateurs, des téléphones et, anciennement, des PlayStation 3 de milliers de volontaires.     





Depuis 2001, les données de simulation ont permis de publier plus de 220 articles dans des revues scientifiques2. Les résultats expérimentaux concordent avec les simulations. Le responsable du projet est Vijay S. Pande, de l’université américaine Stanford.”



Tu as ici les 224 publications.

https://foldingathome.org/papers-results/ Certaines plus parlante que d’autres mais ce n’est pas que du vent, loin de là.


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Cool j’ai rejoins la team. Mais impossible de poster sur le forum, le site ne reconnaît pas mon nom d’utilisateur :(

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fred42 a écrit :



Trop de risque de se faire espionner sur son PC en faisant tourner du code par cette application. Je tiens à ma vie privée.






^^     





Donner un accès potentiel à mes données à un groupe qui oeuvre pour la science c’est pas mal. Mais je préfère donner mes data à facebook/google/microsoft/amazon avec mes comptes chez chacun et toutes les applications liées auquel j’ai donné mon consentement, je n’ai aucun soucis à me faire pour ma vie privée.



Par contre il y a des choses que je ne ferai pas, comme donner de vagues informations de localisation au gouvernement dans le cadre d’une application dont le niveau de confidentialité est cadré par une loi afin d’aider à limiter la propagation d’une pandémie. C’est hors de question !


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<img data-src=" />

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Je sais ce que c’est. Ma question est sur ce que ça apporte pour le coronavirus. Des publications, ok, de quel genre ? Comment vérifie-t-on que c’est F@H qui a permis l’article, et non des recherches plus classiques ?

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Jarodd a écrit :



Ce genre de projets a une réelle utilité ? Ca calcule quoi au final ? Ca aide à trouver un vaccin ?&nbsp;





J’aurais tendance à penser que non seulement ça sert à rien mais en plus ça permet de creuser plus vite notre propre tombe. Mais si vous me prouvez le contraire j’installe ce truc sur ma machine !


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skankhunt42 a écrit :



J’aurais tendance à penser que non seulement ça sert à rien mais en plus ça permet de creuser plus vite notre propre tombe. Mais si vous me prouvez le contraire j’installe ce truc sur ma machine !







Cadeaux :



https://www.numerama.com/sciences/607147-une-intelligence-artificielle-a-concu-u…


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fred42 a écrit :



Trop de risque de se faire espionner sur son PC en faisant tourner du code par cette application. Je tiens à ma vie privée.





Clair: j’espère que tous les codes sont open source et audités par des experts en sécurité indépendants.

Sinon c’est la porte ouverte à un traçage de toutes tes activités par le gouvernement via des backdoors.

Sachant qu’en plus je suis sur que ces salauds vont profiter de la crédulité des gens pour continuer à exploiter le filon même quand on aura trouvé un vaccin.



Je ne comprends pas que NXi ne se soit pas emparé du sujet pour nous pondre un article bien senti sur la dangerosité d’un tel produit sachant qu’en plus rien n’indique qu’il fonctionne si il n’y pas suffisamment de volontaires…


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<img data-src=" />

combo de trolls?

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Methio a écrit :



^^




Donner un accès potentiel à mes données à un groupe qui oeuvre pour la science c'est pas mal. Mais je préfère donner mes data à facebook/google/microsoft/amazon avec mes comptes chez chacun et toutes les applications liées auquel j'ai donné mon consentement, je n'ai aucun soucis à me faire pour ma vie privée.      






Par contre il y a des choses que je ne ferai pas, comme donner de vagues informations de localisation au gouvernement dans le cadre d'une application dont le niveau de confidentialité est cadré par une loi afin d'aider à limiter la propagation d'une pandémie. C'est hors de question !







+1



Tout à fait, aucune inquiétude à cliquer “tout accepter” sans avoir lu aucune ligne du texte de consentement pour des sociétés qui vivent de la vente de données. Par contre, une application échangeant des valeurs aléatoires et vérifiant une liste de valeurs périodiquement pour tester au plus tôt une éventuelle contagion, ça c’est beaucoup trop flippant !


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Comme déjà dit dans la discussion, des logiciels non open-source, sur ton ordinateur ou tout téléphone tu en as déjà pléthore…



Sinon ce que ne précise pas clairement l’article (j’imagine par manque de détails pour le moment) c’est que Stanford annonce le futur passage en Open Source de la solution F@H. A terme, tout le monde pourra auditer ce logiciel.

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barlav a écrit :



<img data-src=" />

combo de trolls?





Regarde le commentaire juste en dessous du tien.


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Une belle palanquée de trolls, de FUD et de débiles dans ces commentaires, dites donc…

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Là ça reste petits bras à côté des articles StopCovid, qui eux en sont remplis.

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J’ai déjà BOINC (World Community Grid) sur 4 machines, mais je ne vois rien passer côté Covid, c’est normal ? Ou Folding@Home est encore un autre projet ?

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Va donc lire les commentaires sur les applis de traçage pour le covid-19, ils sont bien plus forts que moi qui a voulu les copier, mais je suis beaucoup moins doué pour inventer des arguments débiles.









mtaapc a écrit :



Là ça reste petits bras à côté des articles StopCovid, qui eux en sont remplis.





Voilà.


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carbier a écrit :



Clair: j’espère que tous les codes sont open source et audités par des experts en sécurité indépendants.

Sinon c’est la porte ouverte à un traçage de toutes tes activités par le gouvernement via des backdoors.

Sachant qu’en plus je suis sur que ces salauds vont profiter de la crédulité des gens pour continuer à exploiter le filon même quand on aura trouvé un vaccin.



Je ne comprends pas que NXi ne se soit pas emparé du sujet pour nous pondre un article bien senti sur la dangerosité d’un tel produit sachant qu’en plus rien n’indique qu’il fonctionne si il n’y pas suffisamment de volontaires…



en fait c’est sans risque …. ça mine juste des bitcoins, et de temps en temps un ou deux craquages de clefs pour la NSA ;-)

&nbsp;&nbsp;


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PSXBH a écrit :



Une belle palanquée de trolls, de FUD et de débiles dans ces commentaires, dites donc…





Sauf que la c’est du troll assumé, au contraire des commentaires dans les articles sur StopCovid. <img data-src=" />

Voire de certains articles publiés directement sur NXi


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Azerty38 a écrit :



en fait c’est sans risque …. ça mine juste des bitcoins, et de temps en temps un ou deux craquages de clefs pour la NSA ;-)





Je le savais bien. Et dire que NXi demande à ses lecteurs de participer au projet.

Décidément ce n’est plus ce que c’était <img data-src=" />


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Les publications scientifiques sont suffisamment détaillée avec les process pour reproduire…lors de la relecture par des pairs ca se verrait relativement vite.

&nbsp;

Pour des applications direct au niveau du covid c’est un peu plus complexe, la recherche réalisée avec F@H est plus à voir comme de la recherche fondamentale (sans application immédiate). Mais comme dans toute science la recherche fondamentale est nécessaire et indispensable afin d’ouvrir la voie a de la recherche applicative.



Mais plus concrètement tu vas essayer de tester l’action de différentes molécules (médicaments) sur les molécules pouvant composer le virus.

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Quel est le rapport avec un IA et le projet folding ?

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Oui, ce sont deux projets séparés. Si tu veux aider concernant le Covid-19 sur BOINC, il faut rejoindre le projet Rosetta@Home.

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Concernant les projets “life science” et de protection de l’environnement, il n’y a pas que Folding@Home.



Personnellement, depuis Janvier 2007,&nbsp; je contribue aux projets de World Community Grid : WCG https://www.worldcommunitygrid.org).

J’ai rejoint cette plateforme de Grid computing à l’occasion du projet Décrypthon concernant la dystrophie musculaire (projet initié par l’AFM).

J’ai ensuite continué de participer activement aux 30 projets qui ont été ou sont encore actifs.



WCG est en train de lancé un projet de recherche concernant l’identification de traitements potentiels contre le SARS-COV-2 (Covid-19) : Open Pandemic.



WCG est sponsorisé par le département mécénat d’IBM. L’entreprise fournissant les ressources matérielles et opérationnelles.

Les projets de recherche sont développés par des laboratoires de recherche (universités, hôpitaux, ONG, …) à but non lucratif et sont évalués et sélectionnés par un comité scientifique et éthique.

Les résultats des recherches doivent être publiés en tant que “Public Domain” (les dépôts de brevet et de copyright ne sont pas autorisés si les données de recherche utilisées ont été générées via WCG).



L’outil utilisé pour l’ordonnancement des calculs est Boinc (https://boinc.berkeley.edu).

WCG met à disposition une version auditée de Boinc pour les machines tournant sous Windows et MacOS. Les machines Linux utilisent la version de Boinc directement disponible dans les dépôts des distribution Linux concernées.

WCG/IBM réalise également des audits de sécurités des applications projets qui vont tourner via Boinc sur les machines des contributeurs.



Les projets de recherche “life science” permettent de faire de la recherche “in silico”. C’est-à-dire de présélectionner des candidats potentiels pour une thérapie particulière avant de passer à la phase “in vitro” (expérimentation en laboratoire) et ensuite “in vivo” (expérimentation sur des modèles animaux) et, si tout va bien, pour passer en phase clinique (expérimentation sur les humains).



Quelque soit l’urgence actuelle représentée par Covid-19, il est absolument nécessaire pour l’avenir de pouvoir identifier des traitements SÛRS.

Cela n’est possible que si la phase “in vitro” peut être limitée au moyen d’une présélection efficace de candidats potentiels.

&nbsp;

À toutes fins utiles, il faut savoir qu’un nouveau médicament (c’est-à-dire : un nouveau principe actif) est en général le résultat d’un processus de sélection d’environ 10 à 20 candidats potentiels sur un ensemble de 100’000 candidats.

Se reposer sur la seule expérimentation “in vitro” n’est tout simplement pas possible, ni en terme de temps, ni en terme financier.



Les avancées de la recherche “in silico” sont le résultat du développement depuis environ 25 à 30 ans d’une nouvelle branche de l’informatique : la bio-informatique. La montée en puissance des ordinateurs personnels a été le déclencheur pour passer d’une approche “super computer” à une approche “calcul distribué” (grid computing).



N’hésitez pas à rejoindre World Community Grid https://www.worldcommunitygrid.org) en fonction de vos ressources : capacité de calcul de vos ordinateurs et de vos moyens financiers (facture d’électricité).



PS: L’équipe Décrypthon https://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamMemberDetail.do?sort=points&… est toujours active !






  • Déclaration d’intérêt

    Je ne travaille ni pour IBM, ni pour un laboratoire pharmaceutique.

    Néanmoins, dans le cadre de mon activité professionnelle, je m’occupe des questions liées à la validation des systèmes automatisés et informatisés ainsi qu’à leur conformité réglementaire en environnement réglementé pharmaceutique, y compris toutes les questions en lien avec l’intégrité des données.&nbsp;

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BlackKrystal a écrit :



J’ai déjà BOINC (World Community Grid) sur 4 machines, mais je ne vois rien passer côté Covid, c’est normal ? Ou Folding@Home est encore un autre projet ?



&nbsp;

Cf. mon (long) commentaire :nextinpact.com Next INpact



La phase de beta test a démarré la nuit dernière (2021-04-2020). La phase opérationnelle du projet Open Pandemics devrait sans doute démarrer au cours des 2 prochaines semaines.

Pour plus d’information :https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,42232


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skankhunt42 a écrit :



J’aurais tendance à penser que non seulement ça sert à rien mais en plus ça permet de creuser plus vite notre propre tombe. Mais si vous me prouvez le contraire j’installe ce truc sur ma machine !





Cf. la deuxième partie de mon commentaire nextinpact.com Next INpact où je tente d’expliquer sommairement le principe et l’utilité de tels projets de recherche.



Ensuite, libre à chacun de décider ce qu’il trouve bien !



Voir également :

https://www.worldcommunitygrid.org/research/viewAllProjects.do


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skankhunt42 a écrit :



Quel est le rapport avec un IA et le projet folding ?







Le rapport c’est que puissance de calcul informatique peuvent permettre des avancées sur la découverte de traitement pour des maladies cf l’article qui se trouve juste au dessus de l’espace commentaire qui évoque F@H portée sur la recherche du covid-19.



Tu y trouvera un liens pour y participer maintenant que tu as la preuve que ça fonctionne, on attend ta participation avec impatience <img data-src=" />


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Wep !

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